物种多样性是生物多样性的重要组成部分，是衡量一个地区生态保护、生态建设与恢复水平的较好指标。本指标选择代表性的动植物（鸟类、鱼类、和植物）作为衡量城市物种多样性的标准。
物种指数的计算方法如下：
单项物种指数：pi=（i=1,2,3,分别代表鸟类、鱼类和植物）
其中，Pi为单项物种指数，Nbi为城市建成区内该类物种数，Ni为市域范围内该类物种总数。
综合物种指数为单项物种指数的平均值。
综合物种指数H=,n=3
注:鸟类、鱼类均以自然环境中生存的种类计算，人工饲养者不计。
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