细胞质包括基质、细胞器和包含物，在生活状态下为透明的胶状物。
基质指细胞质内呈液态的部分，是细胞质的基本成分，主要含有多种可溶性酶、糖、无机盐和水等。
细胞器是分布于细胞质内、具有一定形态、在细胞生理活动中起重要作用的结构。它包括：线粒体、内质网、内网器、溶酶体、微丝、微管、中心粒等。 线粒体--功能特点是可以合成一些蛋白质 关于线粒体形成的机制，较普遍接受的看法是，线粒体依靠分裂而进行增殖。 细胞质遗传 细胞质遗传的物质基础是细胞质中的DNA，细胞质遗传在实践中的应用很广泛。
细胞质遗传的概念：由细胞质基因所决定的遗传现象和遗传规律，也称为非孟德尔遗传，核外遗传。
细胞质遗传的特性
1. 后代的表型象母亲( 又叫母系遗传,偏母遗传) ；
2. 不遵循孟德尔遗传，后代不出现一定的比例；
3. 正交和反交后代的表型不同。
细胞质遗传的机制
精卵结合中形成的合子父母双亲所提供的遗传物质不均等，在杂种受精卵的原生质体中，核来自于父母双方，而细胞质却几乎完全来自其母亲(精子受精时胞质很少甚至不能进入卵细胞中)。
在细胞分裂过程中，细胞质基因呈现不均等分配，因此细胞质遗传不遵循孟德尔定律。
细胞质遗传的物质基础
线粒体基因组(mtDNA)
叶绿体基因组(ctDNA CpDNA)
细胞共生体基因组
细菌质粒基因组
非细胞器基因组
细胞器基因组
细胞质基因组
叶绿体基因组
1.细胞核遗传与细胞质遗传的区别
(1)细胞核和细胞质的遗传物质都是DNA分子，但是分布的位置不同。细胞核遗传的遗传物质在细胞核中，细胞质遗传的遗传物质在细胞质中。
(2)细胞核和细胞质的遗传桥梁都是配子，但是细胞核遗传雌雄配子的核遗传物质相等，而细胞质遗传物质主要存在于卵细胞中。
(3)细胞核和细胞质的性状表达主要通过体细胞进行的。核遗传物质的载体(染色体)有均分机制，进行均分遵循遗传规律；细胞质遗传物质的载体(具有DNA的细胞器)没有均分机制，而是随机的。
(4)细胞核遗传时，正反交相同.细胞质遗传时，F1的性状均与母本相同，即母系遗传。
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