黑海是一个双层海，上层水多来自多瑙河、顿河等河水的注入，而深层水由于脱胎于古地中海的海盆地，因而盐度很高密度很大，使得上下层水体难以彻底交流。
黑海本是古地中海的一个海盆地，后来经过地壳变化，逐渐与外海隔开了，最终形成了一个内海。
黑海上层的淡水，主要来自于多瑙河，再加上降水量，造成了上层较低含盐量的淡水层。因为表层盐度低，就跟海底形成了一个断层，也叫做密度飞跃层，严重阻断了上下层的水分交流，没交流就没氧气，结果海底就呈现了一片死寂。
因为深海海水缺氧，就成了厌氧菌的天下了。厌氧菌兢兢业业地耕耘着深海，释放了大量的硫化氢气体，剧毒的硫化氢不仅杀死了所有海洋生物，还让海水呈现出黑色。
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