巍山县属云岭横断山脉的南延部份，地处哀牢山和无量山北段地区，和大理点苍山遥遥相望。河谷、盆地、山地相间分布。地势为北高南低，东高西低。海拔高差悬殊大，其中河谷最低海拔1146米，山地最高海拔3037米。
