A．由阿莫西林的化学式C16H19N3O5S可知，这是一种含碳元素的化合物，属于有机物，故A正确；
B．由阿莫西林的化学式C16H19N3O5S可知，其中碳、氧元素质量比为：（12×16）：（16×5）=12：5，故B正确；
C．由阿莫西林的化学式C16H19N3O5S可知，阿莫西林由碳、氢、氮、氧、硫五种元素组成的，故C正确；
D．阿莫西林是由分子构成的，一个阿莫西林分子中共含有原子数为：16+19+3+5+1=44，故D错误．
故选D．
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