出口退税电子口岸交单与到国税提交资料顺序颠倒怎么办？

不用急！不会损失！
根据时间，出口时间到现在不到四个月，只要在本月内，都可以退税，不会有损失！
关键在于：你们以及核销了，而且这个核销是在规定时间内完成的。所以退税问题不大。
按照电子口岸交单的程序操作：用电子口岸卡登录电子口岸网，点击“出口收汇”下提交核销单，然后再点击“国税出口退税”下提交报关单号。这就算完成交单了。
此时你通知国税已交单则可。他们能看得到数据，当然，数据传送需要一点时间，半天或者一天就可以了。

我不知道你是哪个地方，哪个区的？像我们公司属于北京海淀区，报关单的有效期是三个月，但可退到下月的申报期，也就是第四个月的15号。
如果你们公司报关单上的出口日期是1月6号的话，这个月在电子口岸交单，下个月申报就行。
提交的方法：用电子口岸卡登录电子口岸网，点击“出口收汇”下提交核销单，然后再点击“国税出口退税”下提交报关单号。
只有电子口岸提交了核销单才能去银行结汇，结完人民币后，再去外管局的网上核销系统核销这些金额（三万美元以上还要带资料去外管局核销，三万以下就在网上做核销，打印资料即可），否则国税局会没有核销单的信息。
国税局是通过核销单及报关单的信息来做出口退税的。
以上的操作方法是北京海淀区出口退税的方法，其他地方不明，但个人觉得应该是一样的，你可以去当地的出口退税科问一下，祝你好运！

申报出口退税的截止期限为,货物报关出口之日(以出口货物 报关单〈出口退税专用〉上注明的出口日期为准)起90天 后第一个增值税纳税申报期截止之日. 建议企业和主管税务机关说明情况，由主管退税机关决定是否可以办理延期。并递交：核销单、增值税发票、出口货物销售发票。看你的日期很有可能是不能延期需要转内销了，你马上联系你主管国税局说明情况。

马上登录电子口岸提交信息。向国税局申报延期申报（延期申报审批权应该在地市局，不在县级局）。如果运气好等到退税申报的最后期限会有信息也说不定的。