A、果蝇在产生精子的过程中进行减数分裂，等位基因分离，非等位基因进行自由组合，因此同一只红眼雄果蝇的精子的遗传信息不一定相同，A错误；B、多利羊与为其提供细胞核的母羊的细胞核遗传物质相同，细胞质内的遗传物质不一定相同，B错误；C、来自绿萝同一枝条的不定根是通过细胞的有丝分裂过程产生的，遗传物质相同，C正确；D、小麦籽粒是有性生殖产生的受精卵发育而来，遗传物质不一定相同，D错误．故选：C．
