三方协议缴款，是纳税人与税务局和银行签定了三方协议，直接从纳税人签订的三方协议的银行账户中缴纳税款。而银联缴款，则进入银联在线缴税页面，需要纳税人输入可以付款的卡号，然后输入手机号码、验证码等信息，提交后缴纳税款。
