按你所讲的情况可以按工伤处理。你报工伤，与你是否与公司签订劳动无关。只要在公司的范围内，都与公司都有关系。如果公司要按病假处理，你可以收集好受伤时的证明人的书面证明材料(证明人的姓名，身份证号，时间，地点，周围实际状况，受伤经过)，医院的病情证明，医疗处方，收费发票等。待伤好了以后走劳动仲裁。科长心眼如何，你辞工与否，与你的工伤没有任何关系。如果由于工伤而无法胜任工作，则可以提请工伤鉴定，在进行工伤鉴定出来后，再提出工伤赔偿。如果你先提出辞职，按劳动合同法，公司是不赔偿的。
劳动法规定，职工在工作中或者是上下班途中出现的伤亡事故都可以认定为工伤，因此你讲的情况完全可以做工伤认定的。
工作时间造成工伤当然工伤鉴定，也因为工作时机器撞到头部，缝了两针，完全够工伤了。
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