区别应该主要在库函数方面吧，因为平台不同，所支持的库文件也不同（表现在头文件不同，或相同头文件包含的函数不同等），所以一般在不同平台下开发的程序不能在另一平台上运行，不过JAVA等跨平台的语言还是可以在不同平台下运行的。另外，在WINDOWS下的开发工具会比LINUX下多很多。希望我的回答对你有帮助。
