A、金刚石和石墨都是由碳元素组成的不同单质,不是同一种物质.故A说法错误; B、金刚石和石墨都是有碳元素组成的不同单质,碳原子的排列方式不同.故B说法正确; C、金刚石和石墨具有相同化学性质.故C说法错误; D、碳原子的排列方式不同决定了金刚石、石墨的物理性质不同.故D错误. 故选B.