大概是在柯南在为“毛利小五郎”做推理的时候射麻醉针的时候被鲁邦三世看见了，也可能是鲁邦三世是世纪大盗，他也会调查柯南这个身份的档案，在与钱形警官一起合作的时候被警官发现的吧，按常理来说一般的小学生的推理能力和与别的什么的知识都不会那么丰富，而且会注意到小朋友居然可以与服务员擦身而过后，就知道服务员是假的，所以知道了柯南是工藤新一。
