犯罪分子利用违法所得的赃物偿还合法有效的债务不适用善意取得制度，赃款、贪污的款项都应当追回，法院或者是公安机关可能会追回这些贪污款项。将犯罪所得用于归还债务，不论债权人是否明知都不适用善意取得制度，追回赃款的一个考虑就是为了防止腐败和隐瞒转移赃物。相关的法律依据：《刑法》64条、《刑事诉讼法》234条、《联合国反腐败公约》
