先天原因：由物种的基因决定，基因决定了苹果的果皮细胞里含有花色素苷（花色素苷和苹果中的苹果酸作用使苹果皮呈现红色）至于红色的程度不同的原因那就还有后天原因：由生长环境决定，花色素苷在高温和高PH环境中降解加快，如苹果在日平均气温为12~13°C时着色良好，但在27°C时却着色不良，这就是南方苹果不如北方苹果颜色好的原因。其次光照不足也能影响花色素苷的含量，继而影响苹果的颜色！
