1、在H7H9流感防控工作的关键时刻，(在我省)一套信息化应急指挥系统正式启动。
修改为→在H7H9流感防控工作的关键时刻，一套信息化应急指挥系统在我省正式启动。
2、通过这套指挥系统，（使）省预防控制中心工作人员可随时向省领导汇报全省H7N9流感的防控情况，省领导也可以通过该系统对预防工作发出指令。
修改，去掉“使”即可。
3、采取信息化应急指挥系统，对于处理H7N9流感这样的突发事件具有重要作用。
修改为→信息化应急指挥系统对于处理H7N9流感这样的突发事件具有重要作用。
第一句中把 在我省 的在去掉 就有主语了
第二句把 使省疾病 的使去掉 前后主语就一致了
第三句 感觉 最开始的采取和最后的作用不搭配 把采取改成应用吧
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