解:∵△ABC与△DCE都是边长为6的等边三角形,∴∠ACB=∠DCE=60°,BC=CD=6,∴∠ACD=180°-(∠ACB+∠DCE)=60°,∴∠ACB=∠ACD,即CF为∠BCD的平分线,∴CF⊥BD,BF=DF,在Rt△BFC中,∠BCF=60°,BC=6,∴BF=BCsin60°=3 3 ,则BD=2BF=6 3 .故选D