早期的分类主要依靠形态特征,例如林奈根据花的结构为植物分类。演化论诞生后开始利用物种演化发生的历史进行分类,同属一个分类单元的物种都源自相同的祖先,根据在不同环境中发生适应性演化的多少来确定在哪一级“分道扬镳”。目前的“界门纲目科属种”大体上仍遵循这套理论,不管具体方法是线粒体测序还是查化石记录,基本原则是不变的。但每一级分类单元间的差异大小并没有量化的规定,连最底层的“种”都仍缺乏明晰的定义,所以没有问题中所说的可比性。