医院设有45个临床医技科室，9个临床教研室。骨外科、神经内科、泌尿外科、结核科、普外科、神经外科和影像中心被评为滨州市“名科”。普外科被评为山东省优质医疗服务示范科室，骨外科被山东省医院协会评为地市级中心医院临床重点专科，也是滨州市医学重点学科。滨州市麻醉质量控制中心、急诊急救质量控制中心挂靠医院。产科、重症医学科被评为山东省首批护士岗位培训临床教学基地。
