化肥污染是农田施用大量化肥而引起水体、土壤和大气污染的现象。农田施用的任何种类和形态的化肥，都不可能全部被植物吸收利用。化肥利用率，氮为30-60%，磷为2-25%，钾为30-60%。未被植物及时利用的氮化合物，若以不能被土壤胶体吸附的NH4-N的形式存在，就会随下渗的土壤水转移至根系密集层以下而造成污染。可导致河川、湖泊和内海的富营养化;土壤受到污染，物理性质恶化;食品、饲料和饮用水中有毒成分增加。为防止污染环境，应对使用的化学肥料进行控制和管理。
（1）尿素用后不宜立即浇水。
（2）碳酸氢铵不宜施在土壤表面。
（3）碳酸氢铵不宜在温室和大棚内施用。
（4）铵态氮化肥勿与碱性肥料混施。
（5）硝态氮化肥勿在稻田施用。
（6）硫酸铵不宜长期施用。
（7）磷肥不宜分散施用。
（8）钾肥不宜在作物后期施用。
（9）含氯化肥忌长期单独施用，并避免在忌氯作物施用。
（10）含氮复合肥不宜大量用于豆科作物。
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