提取的步骤基本上都属DNA的提取步骤,包括细胞裂解,DNA释放,纯化,最后沉淀溶解。
质粒提取过程中,有一个DNA变性、复性的过程,这个与基因组提取完全不同,这是利用质粒是以超螺旋结构存在于大肠杆菌中的特殊状态,分离纯化质粒时总是会利用这个特点来分离基因组DNA与质粒DNA。
酶切都可用限制性内切酶,酶相同;酶切位点碱基相同;酶切方式相同。如果知道基因组碱基序列,那样对于上面的酶切位点也可以完全清楚。但如果不知道基因组序列,那样就只有随机切,获得一系列片段,电泳结果为弥散条带。虽然基因组dna多为线性,而质粒为环状dna,但是都为双链dna,所以差异不会很大。