A、原子是由原子核和核外电子构成，故A错；B、分子是保持物质化学性质的最小微粒，故B错；C、纯净的氢气在氧气中完全燃烧后，生成水，水是由水分子一种分子构成，故C正确；D、离子是带电的原子或原子团，原子失去电子或得到电子都可以成为离子，故D错．故选C．
