本质上Linux属于Unix体系是用C写的，Windows是微软自创用C和汇编写的。区别只不过是实现的方式不同，基本原理都是一样的，至于安全稳定这都是相对的，Linux和Mac OS X用的人少，编病毒的自然也少。
由于开发人员和面向的用户群体不同，所以Linux更接近底层，开放的东西也多，而Windows相比之下更适合普通用户，当然可定制和修改的东西也少。
Windows是娱乐型操作系统，使用方便、简单，对于没有电脑知识的人员来说，Windows容易上手。而且支持它的硬件多。但系统安全性方面大为艰难，极容易中毒、木马等等。
Linux更容易作为服务器操作系统，在娱乐上要差一些。比如你想玩大型3D游戏，那么只能选择Windows，想玩QQ农场，也只能用Windows。安全性是类linux系统无敌的一方面。
本质上，它们的执行码是不同的。Windows上可以执行的程序拿到linux下运行不起。相反也是如此。
呵呵，LINUX开源、稳定且更安全，WIN不开源也不稳定和安全。个人觉得。
内核不同，开发语言不同
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