您好！您这个问题非常麻烦。
根据您的介绍，与业主签订的是“工程承包补充协议”吧？还是业主与设计单位设计协议的补充协议副本？无论业主还是施工方，在设计单位全套完整的施工图，没有通过有关部门审批，交付，施工交底之前，工程开始建设都是违规不允许的。业主更不能以补充协议代替施工图。作为施工单位应严格按正规施工图承包，施工。您为什么违规呢，您不也是自找麻烦吗。现在，您唯有与业主，设计单位，好好沟通，协商吧。依您的说法，看来业主违规在先。
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