A.位于短周期的X元素的阳离子与Y元素的阴离子具有相同的电子层结构,则两元素的最高化合价不一定X<Y,如Li+和H+,故A错误;B.不是任何物质中都含有化学键,如稀有气体中不含化学键,故B错误;C.共价键可能存在于离子化合物中,如KOH中含有共价键,故C错误;D.过氧化钠中钠离子和过氧根离子之间存在离子键,氧原子和氧原子间存在共价键,故D正确;故选D.