入驻清华科技园的企业入住清华科技园的机构在清华科技园已经建成的30多万平方米的园区内，已经有大概400余家各种各样的机构。这些机构大概分为以下几类：
第一类是国家、部委和清华大学的工程研究中心，例如光盘、液晶、CAD等等。
第二类是世界500强公司在清华科技园设立的研发机构，包括SUN、P&G、Schlumberger和NEC；
第三类是同方、紫光、诚志等清华控股的上市公司的总部；
第四类是清华大学的一些成果转化机构，例如北京清华工业开发研究院、河北清华发展研究院、清华大学科技开发部等
第五类是清华大学继续教育学院等培训机构，这还是一个非学历的培训机构。
第六类是一批金融、投资、法律、咨询等中介服务机构；
持此，还有一类是公共测试平台等技术支持机构和战略联盟。
清华科技园还有一批企业孵化器，如今清华科技园的孵化器包括清华创业园、清华留学人员创业园、生物技术孵化器、IC设计孵化器、国际园-日本和国际园-韩国。
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