增值税发票掉了,能不能申请哪张作废,再重新开一张?

通过一定程序后还可以抵扣的，参考下文：
根据《国家税务总局关于增值税一般纳税人丢失防伪税控系统开具的增值税专用发票有关税务处理问题的通知》（国税发〔2002〕10号）的规定，纳税人丢失防伪税控系统开具的增值税专用发票，如果该发票丢失前已通过防伪税控认证系统的认证，购货单位可凭销货单位出具的丢失发票的存根联复印件及销货方所在地主管税务机关出具的“增值税一般纳税人丢失防伪税控系统开具的增值税专用发票已抄报税证明单”，经购货单位的主管税务机关审核批准后，作为增值税进项税额抵扣的合法凭证抵扣进项税额；如果该发票丢失前未通过防伪税控认证系统的认证，购货单位应凭销货单位出具的丢失发票的存根联复印件到主管税务机关进行认证，认证通过后凭该发票复印件及销货方所在地主管税务机关出具的“增值税一般纳税人丢失防伪税控系统开具的增值税专用发票已抄报税证明单”，经购货单位主管税务机关审核批准后，作为增值税进项税额抵扣的合法凭证抵扣进项税额。

丢失已开具的增值税专用发票不要采用国税发〔2002〕10号文件了，现在有新的规定。

国家税务总局《关于修订<增值税专用发票使用规定>的通知》（国税发〔2006〕156号 ）
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第二十八条 一般纳税人丢失已开具专用发票的发票联和抵扣联，如果丢失前已认证相符的，购买方凭销售方提供的相应专用发票记账联复印件及销售方所在地主管税务机关出具的《丢失增值税专用发票已报税证明单》（附件5），经购买方主管税务机关审核同意后，可作为增值税进项税额的抵扣凭证；如果丢失前未认证的，购买方凭销售方提供的相应专用发票记账联复印件到主管税务机关进行认证，认证相符的凭该专用发票记账联复印件及销售方所在地主管税务机关出具的《丢失增值税专用发票已报税证明单》，经购买方主管税务机关审核同意后，可作为增值税进项税额的抵扣凭证。
一般纳税人丢失已开具专用发票的抵扣联，如果丢失前已认证相符的，可使用专用发票发票联复印件留存备查；如果丢失前未认证的，可使用专用发票发票联到主管税务机关认证，专用发票发票联复印件留存备查。
一般纳税人丢失已开具专用发票的发票联，可将专用发票抵扣联作为记账凭证，专用发票抵扣联复印件留存备查。
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不能。你公司损失的将是增值税部分，不能抵扣了。

　　1.普通发票开错了，可以作废重新开,
　　2.普通发票当月开错了都可以重开，只要将发票各联收集齐并加盖作废印章，同时在开票系统当中作废该发票就可以了，然后就可以重新开发票了。
　　3.如果是增值税普通发票隔月作废，只要将原发票收回，再开一张红字发票就可以了，不用到税务局去申请。

如果增值税发票丢失，有申报或者没申报丢失的增值税发票都必须要到主管税务机关申请丢失作废，而后才能重新再开具增值税发票。