A、染色体组整倍性变化必然导致基因数目增多不是种类，A错误； B、染色体组非整倍性变化不会导致新基因的产生，产生新基因的方法是基因突变，B错误； C、染色体片段的缺失和重复必然导致基因数目的变化，并末产生新的基因，C错误； D、染色体片段的倒位和易位必然导致基因排列顺序的变化，D正确．故选：D．
