合成仪无需模板和引物、dna聚合酶，而是按照人们预先设定的dna序列，从无到有，从头合成（denove），以循环的化学反应合成出dna链（第一个是挂在固相载体上的，以后每次反应通过提供底物-连接反应-洗涤等步骤），而且是单链。pcr仪需要模板、引物和聚合酶，本质是生物合成，一般采用一对引物，合成的是双链dna，无需固相载体。合成的模板序列可以是已知的也可以是未知的。二者合成目的一般也不同。
