大肠菌群能作为食品检验指标的原因之一，就是它的来源比较特别。多存在于温血动物粪便、人类经常活动的场所以及有粪便污染的地方。大肠菌群是一类细菌，它们原本生活在肠道中，有好有坏，并非吃了就会得病。食品中检出大肠菌群，说明食品在加工过程中，存在被污染的风险，这样的食品品质值得怀疑。在加工食品时如操作不规范，就可能出现大肠菌群超标的现象，如果企业有决心，有行动力整改，也是完全可以避免的。
大肠菌群是一种很活泼的菌群
（1）大肠菌群是人和动物肠道中的正常微生物区系，并且只存在于人和动物肠道中。
（2）大肠菌群通常与动物肠道病原菌同时存在，只是数量不同，与动物肠道病原菌抵抗外界不良
环境的能力相似，在体外环境生存的时间与肠道病原菌大致相同或稍长，且有些肠道病原菌难以在食品中检出。
（3）培养、分离、鉴定比较易容。
基于上述原因，通常采用大肠菌群来预测食品被粪便、肠道病原菌污染的可能性。
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