A、分子、原子和离子都是构成物质的粒子，物质不一定都是由分子构成的，故A错误；B、分子是保持物质化学性质的最小粒子，保持二氧化硫化学性质的最小微粒是二氧化硫分子，故B错误；C、原子是化学变化中的最小微粒，故C正确；D、降温能使水结成冰，是因为在低温下水分子间隔发生了变化，分子本身不变，故D错误．故选C．
