根据安全性、疗效、细菌耐药性、价格等因素，《办法》将抗菌药物分为三级：非限制使用级、限制使用级与特殊使用级。
根据《办法》有关规定，医生开处方使用抗生素时，必须根据患者的症状、体征及血、尿常规等实验室检查结果，初步诊断为细菌性感染者才能应用抗菌药物。对于未按照规定开具抗菌药物处方的医生，将被限制、取消处方权，甚至被暂停执业活动。但是针对于《办法》中的条款对于零售药店来说应该是加快了洗牌的速度，促使处方药的管理趋于严格、正轨，但是在执行时还是有很多的漏洞，影响不是很大。
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