学院下设流行病学、生物统计学、卫生毒理与营养学、职业与环境健康学、社会医学与妇幼保健学、理化检验学、卫生微生物检验学7个学系；设有公共卫生与预防医学实验中心，中心下设本科教学与大学生实验室、理化检验与生物学效应实验室、医学信息数据处理实验室、流行病学与微生物检验实验室、SPF动物实验室5个实验室；建有山东大学性病/艾滋病预防控制研究中心、山东大学结核病控制研究中心、山东大学气候变化与健康研究中心、山东大学自杀预防研究中心、山东大学健康老龄与长寿研究中心5个研究中心。
公共卫生学院为一级学科博士学位授权点，一级学科博士后流动站，设有公共卫生硕士专业学位授权点。学院设有预防医学五年制本科专业，包括预防医学、卫生检验、卫生事业管理3个专业方向，面向全国招收本科生。学院还设预防医学、医学检验、食品质量与安全等专业的专科、本科成人和网络教育。
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