A、胰蛋白酶比胰蛋白酶原少了6个氨基酸，6个氨基酸里面含有4个肽键，它从胰蛋白酶原三切多时破坏一个肽键，所以应该少6个肽键，故A错误；B、从图三可知胰蛋白酶原切多6个氨基酸后与胰蛋白酶空间结构不同，故B正确；C、肠激酶与限制酶都具有专一性，在特定位点切割，所以具有相似的作用特性，故C正确；D、胰蛋白酶原在胰腺分泌出来时没有活性，到了小肠后才有活性，所以避免了对胰腺蛋白质的消化，故D正确．故选A．
