如果只要a，b内文件夹中的文件名不一样的话，就只要把a或者b中所有的同名的文件夹剪切过去就是同一个了。
如果a，b内文件夹中的文件部分文件名一样或者文件名一样，内容不一样的话，就只能手动一个一个去改名复制了。
如果以上不行。尝试下下面的方法。
可以尝试用cmd命令试试。首先命令 comp /? 根据提示对比出相同的文件夹，然后再根据上条命令匹配出来的结果复制，再用命令 copy /? 根据提示，进行批量命令复制。
全选（按ctrl+a）其中一个文件夹然后复制，再粘贴到另一个文件夹即可
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