A.间二甲苯和乙苯是分子式相同,结构不同的化合物,互为同分异构体,故A错误; B.2-甲基2,4-己二烯和3,4-二甲基-1-戊炔分子式相同,结构不同的化合物,互为同分异构体,故B错误;C.2,2,3-三甲基戊烷和3-乙基己烷分子式相同,结构不同的化合物,互为同分异构体,故C错误;D.2-甲基丙烯酸和甲酸正丙酯分子式不同,不属于同分异构体,故D正确.故选D.