海关备案是行政许可吗？不办备案海关可以处罚吗？

海关备案有很多种。比较常见的是报关单位注册登记（俗称“海关备案”）。此外还有加工贸易手册备案、减免税备案、保税仓库备案等等，都是普通说的“海关备案”可能包括的内容。所以，您的问题所提供的信息太少了。
至于是否处罚，有两种情况：
一种是不存在处罚的问题。如对于前面所举的“海关备案”，是办理一定的海关业务的前置条件，比如对于一般的进出口货物收发货人（不是专门的俗称“报关行”的报关企业），如不办理报关单位注册登记，就无法以自己的名义办理进出口海关申报。但不办理的话，后果只是无法办理一定的海关业务，不存在处罚的问题。 又比如不办理减免税备案的话，就无法享受相应的减免税优惠，也不存在处罚的问题。
另一种是法律、行政法规和规章明文规定需处罚的行为，比如《海关行政处罚实施条例》规定，未经海关注册登记从事报关业务的，予以取缔，没收违法所得，可以并处10万元以下罚款。

备案不是行政许可审批中的一种形式。
行政许可的形式：普通许可、特许、认可、核准、登记以及法律、行政法规规定可以设定行政许可的其他事项。
海关实施处罚，必须依照国家法律法规进行。如果法定在海关办理的某事项必须备案，而您没有备案，海关是一定会依法处罚的。

海关备案不属于行政许可，比如进出口货物收发货人的备案登记就不属于行政许可，但是报关企业的登记就属于行政许可。
法律、行政法规设定的海关行政许可项目目录
(1)报关企业注册登记;
(2)报关员资格核准及注册登记;
(3)出口监管仓库、保税仓库设立审批;
(4)进出境运输工具改、兼营境内运输审批;
(5)海关监管货物仓储审批：
(6)免税商店设立审批;
(7)加工贸易备案(变更)、外发加工、深加工结转、余料结转、核销、放弃核准;
(8)进出口货物免验审批;
(9)暂时进出口货物的核准;
(10)报关单修改、撤销审批。等。