①海马，用鳃呼吸，用鳍游泳，具有鱼类的特征是鱼类，①正确；
②鲨鱼用鳃呼吸，用鳍游泳，具有鱼类的特征是鱼类，②正确；
③娃娃鱼幼体生活在水中，用鳃呼吸，用鳍游泳，心脏一心⑤房一心室；成体生活在山上水中，但是用肺呼吸，心脏二心房一心室，属于两栖类，③错误；
④鳄鱼用肺呼吸，体温不恒定，体内受精，卵自然孵化，是爬行动物，④错误；
⑤鱿鱼体柔软，有外套膜，是软体动物，⑤错误；
⑥鲫鱼，用鳃呼吸，用鳍游泳，具有鱼类的特征是鱼类，⑥正确．
综上所述，①海马；②鲨鱼；⑥鲫鱼均属于鱼类，故选项A正确．
故选：A．
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