我1997年在中央党校大专毕业，之后报考了成人本科，考入兰州交通大学的函授本科现在毕业却拿不到毕业证？

是的，党校的毕业证确实是无法在学信网上查到的，所以你只能从新考个专科的学历去
成人教育分为：自学考试，成人高考，中央电大和远程教育几种形式，
成人高考的学历现在已经在逐步淘汰了，如果你已经工作了，建议不要上这种形式的，成人高考的学历分为三种：脱产、函授、业余。其中脱产的基本上已经全部取消了，函授和业余的是每学期集中授课一到两周，但是现在的面授课已经被扭曲了，老师根本不讲课，都是给你画一下考试重点就完了，你根本学不到东西。而且成人高考的学历毕业也慢，从你成人高考名开始到你开学就要经过大半年的时间了，然后从入学时间算起，还要学两年半才能毕业。等你拿到毕业证还要再拖几个月，所以全部耗时下来要三年半的时间了。太浪费时间了。
建议你可以选择中央电大或者网络教育的学历，一年两次注册，注册就直接入学了，然后两年半准时毕业，每个专业的每一门课网上都有教学视频，只要你有时间还能上网，你就能自主学习，教学站一般也都会有面授课，考试也比较简单。
自学考试时所有成人学历考试中 最难的一种，耗时也是比较长的，基本上你考完需要三到五年的时间。所以如果你没有足够的时间去看书备考的话，建议不要选择自考的。
有什么不明白的可以详细咨询我

听说党校的大专不算国民教育，国家根本不承认学历的

建议你现在读个网教的专科，毕业后就可以拿到你的本科毕业证了

这个问题在早些年属于常见的情况，由于早些年，大家都以为去党校读书是相当的有面子和可靠的，其实不然，党校毕业不属于国民教育范畴，所以你有无法顺利达到成人的本科学历，但是我有点质疑你当地的招生办，为什么没有在参加成人高考的现场确认的时候，审核出来？在这一点上你可以质问你所报的学校或者招生办，白白浪费那么长时间，原本以为可以拿到毕业证书，却`````如果不能顺利毕业，那也要你所报学校赔偿你的损失，尽量将自己的损失降到最低。
之前既然已经承认，那为什么还会有后面的问题？至少这些问题都是你所报学校的问题。
反正你自己看，也咨询下你当地的教育局及招生办，将你的损失降到最低。