房屋买卖，经测绘部门测绘得到面积比房产证面积少6个多平方米，怎么会相差那么大？可以申请重测吗？

当然可以，但是房产测绘机构出具测绘报告是要收取服务报酬的。

不知道你所购买的房屋的情况，你可以去房地产产权部门查询该房屋的历史资料，看看该房屋到底是什么原因致使面积出现这么大的误差。

只要不是对房屋进行了结构性改造装修，一般情况下不会有很大误差（比如装修的时候把阳台伸出去一部分），因为房地产建筑面积测绘是有严格国家标准的，而且在测量过程中也是多次测量后取平均值。

出现这么大的误差，可能存在以下的原因：
不知道你的产权证上的面积是什么时候测绘的结果，可能是两次测绘成果的计算规则或者口径不一致造成的。因为在2000年2月22日国家质量技术监督局发布了《房产测量规范》（国标GB/T17986-2000，2000-08-01实施）。因此，当时你家房屋面积数据可能是参加房改前测绘的结果，然后买断产权办理产权证的时候就按着那个数据登记造册并下发了产权证。
也可能是当时对公摊面积的计算出现的差别，房改房产权面积是不包含公摊面积的，而商品房产权包含公摊面积。
还有可能是，90年代正是我国进行住房制度改革第二阶段到第三阶段的过渡期，也是我国颁布《城市房地产管理法》（1994年颁布实施）的最初几年。所以，可能存在着一些方面的漏洞与不足。比如，为了某种目的，人为的将产权面积做大等等。

总之，现在的房地产面积测绘，一是要查找当时建筑物的建筑档案资料，二要有资格的房地产测绘机构实地测量。所以，你对面积有异议的话，完全可以申请房地产面积测绘机构重新对你家的房屋进行测绘并出具测绘报告，并按现在的面积进行变更登记。

可能是房产证上含有外面平摊的公共面积吧。

这是很正常的，以前办的房产证可能业务水平很粗糙，有些就皮尺拉个长宽，面积计算这块不规范，也许只算一半面积的（比如未封闭的阳台）给你全算了，现在房屋测绘规范多了，你应该更相信现在的结果。注意看看测绘部门的有没有漏测出顶间。
如果是公寓楼的话，问问有没有算公摊进去。