投资者以存货出资投入企业的存货视同销售，所以要缴纳增值税，分录为：
借：原材料
应交税金--应交增值税--进项税
贷：实收资本
因为增值税是一种流转税，虽然你暂时付出，但是要最后的消费者承担
而且投资方在购买原材料时也是交了增值税
投资者投入的存货，将不可抵扣的增值税进项税额，计入存货成本（e.g. 库存商品等）。
作为一般纳税人，是可以抵扣的，因此不计入存货成本，计入应交税费进项税额。
库存商品等+可抵扣的应交税费进项税额=为取得存货所付出的=所有者权益的增加
我的理解是，虽然该进项税后期可以抵扣，但是也要发生在被投资方出售这项存货，开具增值税发票后。这是未来的事，目前增值税进项税没有抵扣，仍然是为取得存货付出的一部分。
可以参考出售商品的会计分录，看增值税是如何抵扣的：
借：比如银行存款
应交税费-增值税（销项税额）
贷：比如库存商品
应交税费-增值税（进项税额）
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