在细胞周期中，核仁进行分离和重新聚合的过程。当细胞进入有丝分裂时，核仁首先变形和变小；其后染色质凝集和停止核糖核酸（RNA）合成，包含有核糖体RNA（rRNA）基因的DNA袢环逐渐收缩回到相应染色体的核仁组织区；核膜破裂进入中期，这时核仁消失；在有丝分裂末期时，核仁组织区DNA解凝集，rRNA合成重新开始，极小的核仁重新出现在染色体核仁组织区附近。核仁形成后常发生融合现象。如人二倍体细胞在相应有丝分裂后，10个小核仁长大后相互融合形成在间期细胞中的一个较大的核仁。核仁的重建过程与原有的核仁组分的协助和参与有关。
前期：核仁核膜消失，产生纺锤体
中期：染色体向两端移动，形成赤道面
后期：着丝点分裂成2个，染色体暂时加倍
末期：纺锤体消失，核膜和核仁重新出现，形成2个新的细胞核，最后形成2个新的子细胞
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