蓝细菌是蓝藻的旧称,而藻类包括单细胞的和多细胞的,单细胞的如衣藻属原生生物,多细胞的习惯称藻类植物如空球藻,团藻,水绵(绿藻类),硅藻,海带(褐藻类)等,可见藻类不属微生物,因多数肉眼可见。
蓝细菌是一种含有叶绿体的细菌,而藻类属于植物。