第一部是主要介绍了【放电妹】御坂美琴的个人能力和周遭伙伴之间的故事（当然也是最BT的。。全是白井黑子）作为动画第二期的《科学超电磁炮S》则以漫画版“妹妹篇”剧情为主线。[
前者讲的是她们相遇、相知、到相识。第一季前12集是原作漫画剧情， 后12则是原创。S是第二季，前16集是主线剧情。 后8集是原创剧情，而且还换了监督。
