氢键不属于分子键作用力，强度也远超过一般的分子间作用力。氢原子与电负性大、半径小的原子X（氟、氧、氮等）以共价键结合，若与电负性大的原子Y（与X相同的也可以）接近，在X与Y之间以氢为媒介，生成X-H…Y形式的一种特殊的分子间或分子内相互作用，称为氢键。分子内氢键就是本分子的氢原子跟分子内其它原子形成的作用，不同于化学键。分子间氢键就是一个分子的氢原子跟另一个分子的原子形成的作用，不同于分子间作用力。
