劳动仲裁分为两种，个人仲裁和集体仲裁。申请仲裁你要准备的资料有：身份证、劳动合同、公司解除劳动关系的通知书或证明、近十二个月的工资流水、社保缴费记录、就职公司的信用网信息。
1、劳动合同，2、所工作期间的考勤或能够证明在其工作的证明（工资单、工作记录等与工作有关的东西都可作为有效的证据）。3、证明你老婆怀孕期间的医学证明，这都可作为证据使用的。
如果没有劳动合同的话，那该公司更是违反了劳动合同法的（试用期的话有试用合同的哦），有我说的2条证明也是可以的，带上这些材料和身份证去到公司所管辖的区劳动局，申请填表，工作人员会给你更完善的解决方案，仲裁未果的话，劳动局会给你提供上诉所需的建议，可以申请上诉。希望我的解答能够帮助到您！
可以申请仲裁。
你首先需要明确诉求，这期间一共扣了那些钱，你希望拿回那些钱。
相应需要提供扣款单，或是绩效考核单据等，以及这些钱不应当扣除的证据。请假的电话记录等。
不过这种情况你需要考虑维权的代价。
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