这一领域的许多误解似乎来自于对使用纯果糖进行的研究和使用HFCS进行的研究的混淆。果糖天然存在于水果、蜂蜜、某些蔬菜、甘蔗和甜菜中。
果糖似乎以一种不同于其它糖的方式影响食欲和饱腹感，并被假设为能增加患肥胖的风险。
使用高剂量纯果糖（非HFCS）的研究发现，与葡萄糖相比，果糖似乎能降低胰岛素和瘦素leptin（两者都与过饱相关）的水平，升高胃促生长素ghrelin的水平，后种激素似乎可以影响我们对饥饿的感知。因此就导致这样一种理论的形成，即HFCS能够影响正常的食物摄入，从而引起脂肪聚积增加。然而对HFCS和蔗糖的研究发现，这些甜味剂对胰岛素、瘦素或胃促生长素的影响并没有差异，即使它们的摄入量远远高于平均摄入量。
使用非常高剂量果糖进行的研究报道，果糖可以升高血甘油三酯的水平。然而研究中使用的剂量远远超过日常饮食中的剂量，且没有关于使用HFCS的研究。由于HFCS与蔗糖的组成相似，因此预期它与蔗糖有相似的代谢效应。典型饮食中的蔗糖数量并未显示出能增加甘油三酯水平。
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