我是一家公司的法人 有百分之40的股份，公章和财务章及营业执照副本都在我这里，我可以自己去注销公司吗？

你是公司制企业，一切以《公司法》、《公司登记注册管理规定》为框架去做。
你公司原来三个股东，现在两个股东，是否在工商局办理了股权变更的备案手续？一切以在工商部门的登记备案的股东为准。
公司注销有法定程序：公告、结清税务、财产清算、工商注销等 ，需要所有股东签署注销文件。

不可以，你必须要有公司章程及股东决议的证明材料，而且必须要有其它股东的签名，还要成立清算组，首先要去税务部门结清税款，有税务部门的证明，才能去工商局注销。

公司注销是需要股东会决议的，以及全体股东的身份证原件复印件以及签字的，你一个人无法注销公司的

不可以，法定全体股东都同意，还要全体本人到工商局签字

股东会纪要
一　时间：
二　地址：
三　参加人员：

四　会议内容：
1、 由于XXXXXX………原因，一致同意注销XXXXXX公司。
2、 公司于XXXX年X月X日成立清算小组，选举XXX，XXX……为清算小组成员，XXX为组长，对公司的资产进行清算。
3、 一致通过清算小组的清算报告。
4、 根据清算报告，公司资产处置情况如下：…………。
5、 公司债权债务已清理完毕，清算工作已完成，由XXX向工商局办理注销手续。

　　　　　　　　　　　　　　全体股东及委派代表签字盖手印：

　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　

　年　　　月　　　日
注销公司，需持《股东会议纪要》，即税务登记已注销、债权债务已清理完毕。并在当地工商局制定的媒体公告声明1个月。方可办理工商注销。
鉴于你所诉情况，你最好与另一股东协商，签署一份股份转让协议和你与另一股东（全部股东）的签字同意书即可，然后去工商做变更登记。