爷爷好像患有老年痴呆症，他重新分配财产是否有效

如果你爷爷被确诊为老年痴呆，且能证明重新分配财产的当时候确实意识不清，那么重新分配的行为可能无效。
你所说的公证人应该是自然人身份的见证人吧？如果是这种情况下，只要是立遗嘱人的真实意思表示，就可以变更遗嘱。但是在奶奶已去世的前提下，你爷爷能够处置的仅限于他的个人财产部分。因此，如果是在你爷爷意识清醒的前提下变更的遗嘱，处分你爷爷个人财产的部分有效，且在他有生之年可以不断的变更遗嘱，在分配遗产时以他最后订立的遗嘱为准。

据你所述，有如下几个问题需要证实：
1、爷爷奶奶留有的遗嘱是自己亲自写的，还是找人代书的？如亲自写的，并有签字，过世后，遗嘱放生法律效力。如找人代书的，那么你说有公证人，公证人是否为2个与被继承人无厉害关系的自然人，是否在遗嘱上签字？签字的，爷爷奶奶一人过世，遗嘱生效。没有签字，遗嘱由于缺乏法律要件而无效。子女是否签字不影响遗嘱效力。
2、2套房子应该为爷爷奶奶的夫妻共同财产，可以由其共同立遗嘱处分，一人先过世，共同财产中一半作为个人财产先产生继承，也就是说其中有套房屋已经发生继承了，具体哪套，需要看遗嘱约定。
3、现在，爷爷只能处分属于他的那套房屋，属于奶奶的房屋已经发生继承。爷爷如从新处分个人财产，基于患老年痴呆，建议去三甲医院做精神状况的鉴定，以此保证其行为的效力。

其真实意思表示即有效
纵横法律网-山东天矩律师事务所-张亮律师