土地承包经营权证肯定不是盖村民小组的章。就目前，农村的村民小组不属于独立的法人，它仅仅是村民委员会的一部分。土地承包经营权证是农户与发包方（村民委员会）签定的书面承包协议并赋予的有效法律证件，有的地方要求县级农业主管部门、乡镇政府（或乡镇农业主管部门）加盖公章。村民小组不是有效的法人单位，拥有公章的资格都没有，若要体现村民小组的“公”，必须是村民小组长签字、所在组的村民代表签字或者是村民小组长签字、组员大会（参照村民自治的有关政策）到会人员签字。
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