那曲县属高原亚寒带季风半湿润气候区。这里冬季长达近半年，年温差小，昼夜温差大；年平均气温为-2.2℃，元月份平均气温-14.5℃；全年没有绝对无霜期，每年十月至次年五月为风雪期和土壤冻结期，六月到八月为生长期。年降水量为406.2毫米，多集中在六月至九月间。年蒸发量为1811.2毫米，相对湿度只有51%。气候特征是干燥、多风。
高原寒冷气候，那曲进内海拔已经有4000多米，四面全是雪山。
